Στον προθάλαμο του 1ου ορόφου, αντικρίζουμε ένα από τα σημαντικότερα κειμήλια που υπάρχουν, για την Θεσσαλονίκη. Είναι το πρωτότυπο <<Πρωτόκολλο Παράδοσης της Θεσσαλονίκης>> στους Έλληνες και υπογράφηκε στις 26 Οκτωβρίου 1912, από τον τοτε διοικητη της πόλης, Οθωμανό Στρατηγό Χασάν Ταχσίν πασά και τους αντιπρόσωπους του Διαδόχου του θρόνου Κωνσταντίνου. Στον προαύλιο χώρο του Μουσείου εκτίθενται πυροβόλα, ελαφρά άρματα μάχης, τορπίλες, μαχητικό αεροσκάφος και οχήματα μεταφοράς προσωπικού που ανήκουν στη συλλογή του Πολεμικού Μουσείου.